Результаты ancestryDNA

Хочу извиниться перед читающей меня аудиторией, или перед теми кто когда-то меня читал, за длинный перерыв и отсутствие постов. Два года сюда не заходил. Причиной стали житейские дела - все свободное время уходило на учебу. Но мой интерес к теме о ДНК никуда не пропал, надеюсь, и ваш тоже. В этом посте я расскажу о результатах теста AncestryDNA. Вкратце, AncestryDNA меня не впечатлил.
На главной странице личного кабинета сайта есть три больших блока.

В первом блоке - DNA Story показан предполагаемый этнический состав ваших предков. Мне, например, определили, что 96% моих потенциальных предков из Чехии, Словакии, Польши и Литвы и только 2% из Финляндии и России. Хотя я и не очень глубоко знаю происхождение своей семьи, такая картина мне кажется странной. В 23andme эта часть называется Ancestry Composition и там мне нашли гораздо больше разных регионов происхождения предков. Возможно, не стоит опираться на собственные догадки о происхождении, но Ancestry Composition от 23andme кажется для меня более правдоподобной. На картинках ниже слева результат AncestryDNA, справа 23andme.

Такая разница в предсказанных результатах объясняется разным подходом компаний к расчету этнического состава. Обе компании сравнивают ДНК людей с известным происхождением с вашими результатами. Но вот базы данных из которых компании берут ДНК для сравнения отличаются. AncestryDNA сравнивает ваши данные с ДНК трех тысяч людей разного происхождения (подробнее на самом сайте AncestryDNA). Все 3000 образцов разделены на 26 регионов (таблица с регионами на сайте). Любопытно, что Финляндия/Россия это один регион в классификации и на него приходится всего 59 образцов, плюс в регионе "Восточная Европа" с 432 образцами нет России. Видимо, именно из-за такого маленького количества сравниваемых образцов для России AncestryDNA рассчитал мне такую странную картину происхождения предков. Что же касается 23andme, то они используют 11 091 образец со всего мира плюс ДНК из двух научных проектов (Human genome diversity project и 1000 Genomes project). Короче говоря, выходит, что происхождение от 23andme гораздо точнее, хотя бы исходя из того, что база для сравнения ДНК у них, как минимум, в четыре раза больше чем у AncestryDNA.
В блоке DNA Story есть также предполагаемая история, как я оказался в месте прохождения теста. Так как я хитро отсылал свои результаты через shipito, как будто я нахожусь в США, AncestryDNA считает, что мои предки из Польши, Литвы и прочих соседних стран иммигрировали в Америку в 1875-1900 и далее в начале XX века обжились где-то в районе великих озер и Нью-Йорка.

Как вы, наверно, догадались это неверная догадка - ни по поводу предков из Польши ни по поводу иммиграции в США.
Во втором большом блоке DNA Matches, как понятно из названия, находятся потенциальные родственники. Основным преимуществом базы AncestryDNA является ее размер. Из всех компаний, предоставляющих ДНК тесты у AncestryDNA самая большая база. Согласно таблицы отсюда, на май 2018 у AncestryDNA в базе уже свыше 9 миллионов человек, тогда как у 23andme только 5 миллионов.
Что касается поиска и сравнения потенциальных родственников, то можно искать по фамилии и месту. Зайдя в профиль интересующего родственника можно увидеть людей с которыми у вас с интересующим родственником имеются общие родственные связи (общие участки ДНК). Сколько всего родственников нашлось в AncestryDNA я нигде увидеть не смог - доступен только список родственников. Никаких сравнений по участкам хромосом как в 23andme с потенциальными родственниками нет. Вообще никаких упоминаний про хромосомы на сайте не видел.

Сам сайт ancestry.com очень мощный ресурс для генеалогического поиска особенно для США. Можно искать по куче различных баз - переписи населения, газеты, списки пассажиров - чего там только нет. Но все преимущества ancestry.com доступны только по платным подпискам. Кроме этого некоторые пользователи создают генеалогические деревья в ancestry, но опять - чтобы посмотреть деревья пользователей нужно купить подписку. Цены на подписки не очень радуют.

Третий большой блок DNA Circles в моем случае пустой. Если вы хорошо знаете свое генеалогическое дерево и создали его на ancestry а также связали дерево с ДНК тестами, то есть шанс попасть в ДНК круг в случае если будут общие ветви в вашем и чужих генеалогических деревьях. Подробно данный блок описать не могу, т.к. у самого таких кругов нет. На форумах по ДНК генеалогии многие считают круги бесполезными.
Кроме трех упомянутых блоков на главной странице личного кабинета есть приглашение поучаствовать в различных опросниках, результаты которых будут использоваться в научных исследованиях.
И последнее - в 23andme недавно появилась функция поделиться ссылкой на свои результаты. Вот, например, как выглядит информация по этническому составу предков для моего профиля - мой профиль 23andme. Если я захочу похвастаться своим богатым происхождением, достаточно одной ссылки и все откроется на отдельно созданной странице на сайте 23andme.  AncestryDNA предлагает мне сохранить на выбор 3 файла картинки разного размера с моим результатом. Какие блин картинки, на дворе 2018 год!

Итог

AncestryDNA - самый худший вариант генетического теста из всех, что я пробовал. Информация по этническому составу, как мне представляется (на 100% не могу быть уверенным), очень далека от истины, потому что база для подсчета этнического состава очень маленькая, и в моем случае почти не включает интересные для меня регионы.
Поиск родственников ничем не выделяется, отсутствуют любые инструменты для сравнения участков хромосом.
Функция DNA Circles в моем случае никакой информации не дает.
Везде, где может быть потенциально интересная информация по родственникам сайт предлагает купить подписку.
Не понимаю, откуда берутся положительные отзывы на этот продукт, и почему у них столько клиентов. Видимо, ancestry самый популярный из всех подобных сервисов и людям просто не с чем сравнивать. AncestryDNA это красивая обертка, модный сайт, все гладко работает, но внутри скудный набор бесполезных инструментов.
Если вы хотите сделать себе ДНК тест, лучше остановиться на 23andme.

Опыт заказа ancestry DNA

После недавних комментариев о том, что компания 23andme перестала принимать наборы, присланные не из страны, в которую они покупались, я решил попробовать сделать генетический тест так, будто я нахожусь в США. А именно заказать набор на американский адрес и отправить его в лабораторию по входящей в комплект предоплаченной доставке.

Так как, результаты 23andme у меня уже есть, причем как для меня так и для моих родителей и некоторых родственников, я решил попробовать тест ancestryDNA. Сразу оговорюсь, способ, который я тут раскрою, не сработает с 23andme, но с ancestryDNA у меня все прошло гладко.

Был приятно удивлен, что база ancestryDNA больше 23andme, считав до этого последнюю абсолютным лидером на рынке ДНК тестов.

Пара слов о компании ancestry.com, продуктом которой является ancestryDNA:

Ancestry.com это самая большая компания, предоставляющая генеалогические услуги, в мире, дислоцируется в штате Юта, который многим известен мормонами. Мормоны это представители церкви Иисуса Христа и святых последних дней (LDS), приходы которой находятся по всей России. Вы могли встречать миссионеров-мормонов на улице, обычно это молодые люди или девушки 19-24 лет, приезжающие на два года из США чтобы проповедовать.
История ancestry.com тесно связана с церковью LDS - так, первый продукт компании основан на записях мормонов, очень трепетно относящихся к своей генеалогии.

В данный момент, судя по сайту, база ancestryDNA насчитывает более 2 миллионов образцов, что весьма внушительно.

Помимо ancestryDNA, компания предоставляет продукты для генеалогических исследований. По платной подписке вы получите доступ к куче всевозможных баз, например, переписям населения в США, базам натурализации, смертей, браков и многих многих других. Базы постоянно обновляются.

Заказ теста

Тест ancestryDNA стоит 99 долларов, в отличие от 199 долларов для 23andme. Пройдя по этой ссылке, вы сможете купить ancestryDNA за 89 долларов.
При заказе набора в страну не из этого списка: 

придется воспользоваться почтовым форвардером. Я для этих целей, как и для отправки обратно, использовал shipito.com

После регистрации в shipito.com у меня появился почтовый адрес в США, на который я и заказал набор ancestryDNA. Чтобы отправить набор в Россию из шипито использовал доставку Boxberry Local Pickup, которая мне обошлась в 23 доллара.
Набор 23andme через почтовых форвардеров заказать нельзя, т.к. судя по постам с форума molgen, компания не отправляет тесты на их адреса, однако можно попробовать услугу "помощь в покупке" -> "покупка через посредника" в shipito.
Прохождение теста
Набор ancestryDNA включает пробирку со штрих-кодом, который необходимо ввести в своем личном кабинете на dna.ancestry.com, тем самым привязав образец к своему аккаунту, инструкцию по выполнению теста, небольшую коробку с предоплаченной доставкой и полупрозрачный пакетик с куском адсорбера.
Процедура сбора анализа очень проста - минимум за 30-60 минут до сбора слюны нельзя есть, пить, курить, жевать жвачку и вообще лучше ничего не класть в рот. После такого "воздержания" надо поплевать в пробирку, чтобы слюна дошла до указанного уровня. Дальше нужно закрыть пробирку идущим в комплекте колпачком, в котором находится консервирующая слюну жидкость.
В отличие от 23andme, на наборе ancestryDNA я не нашел информации о сроке годности или дате выпуска пробирки.
Отправка теста в лабораторию в США
Чтобы послать набор обратно из России и симулировать отправку из США я сделал следующее:
сначала я отправил коробку с пробиркой на свой американский адрес в шипито, затем когда моя слюна дошла,

заказал на шипито специальный запрос следующего содержания:
1 Open the blue envelope.

2 You will find a small white box with USPS shipping label on it inside the blue envelope.

3 Return the box with the USPS shipping label provided
За два дня мой запрос выполнили, цена обработки составила 12 долларов - 5 долларов специальный запрос + 2 доллара обработка отправления + 5 долларов - ускоренная обработка.
И через день после выполнения запроса я наблюдал путешествие посылки по США от шипито в лабораторию в Юте.

Примерно через 2 дня после того, как согласно трек-номеру посылка была доставлена, мне пришел имейл от ancestry:

Теперь в своем аккаунте я вижу следующую картинку:

Резюме
Итого на тест я потратил:
134 доллара (99 сам набор + 23 отправка в Россию + 12 обработка специального запроса)
1500 рублей отправка EMS почтой на свой адрес в шипито.
Всего (по курсу 66 рублей за доллар) - 10 344 рубля.
Можно сэкономить 5 долларов на специальном запросе и не делать его ускоренным, также 10 долларов можно сэкономить, заказывая тест по ссылке, ну и отправлять в Америку можно было обычной почтой за 500-600 рублей.
Итого, проходя тест максимально экономно, можно уложиться в 8400 рублей.
По времени, с момента оплаты мной набора до имейла, что пробирка получена прошло 56 дней. Однако я не особо торопился отправлять набор на разных этапах его путешествия.
Думаю, если стараться все делать очень быстро, можно уложиться в 40-45 дней.
Ждем первых результатов теста...

Интеллект определяет продолжительность жизни

Научные исследования на тему умственных способностей показывают, что у людей с высоким уровнем интеллекта выше продолжительность жизни. Однако пока не до конца ясна причина такой корреляции. Возможно умные люди имеют социальный статус, который позволяет им лучше следить за здоровьем, а возможно что в таком совпадении замешана генетика, влияющая и на интеллект и на долголетие, а может вообще все сразу. 

Причину корреляции и попытались выяснить авторы недавно опубликованной научной статьи "The association between intelligence and lifespan is mostly genetic".

Исследуя однояйцевых и многояйцевых однополых близнецов, ученые выяснили, что связь между интеллектом и продолжительностью жизни на 95% регулируется генами.

После анализа данных было установлено, что более смышленый близнец обычно живет дольше. Причем данная тенденция была более явной у многояйцевых близнецов.

Тем не менее связь между интеллектом и продолжительностью жизни хоть и есть, но очень мала, поэтому при наличии большого IQ не спешите обзаводиться вредными привычками.

Автор работы Rosalind Arden считает, что гены делающие нас умнее, делают нас более здоровыми.

Безусловно, требуются дальнейшие исследования для установления деталей явления.

23andme предоставляет следующий SNP для характеристики интеллекта:

rs363050 - AG - обычный IQ, AA - IQ в среднем выше на 3-4 пункта, GG - IQ на 3-4 пункта ниже чем у AG. 

Авторы исследования, где участвовали данные rs363050 оценили влияние данного параметра на разброс в значениях IQ всего в 3,4%, поэтому серьезно к этим данным относиться не стоит. Исследовались данные индивидов с европейским происхождением.

Опыт с 23andme

Недавно, бороздя страницы интернета, я наткнулся на информацию о некоей американской фирме предоставляющей услуги по генетическому анализу. Очень заинтересовался и сделал тест в этой фирме под названием 23andme. Далее, разбираясь с результатами, я узнал о другой фирме, в которой сделал еще один тест. Еще заказал тест в 23andme для мамы и планирую протестировать всю семью.
В общем, меня очень затянуло исследование собственной ДНК и, несмотря на инженерное образование, я немного стал разбираться в генетике - понимать самые азы. В этом блоге я хочу поделиться своими открытиями.
Так что же я узнал после теста 23andme? Результаты можно разделить на две категории: 1) особенности моего организма, мое здоровье и 2) генеалогическая информация. Если конкретнее, то по здоровью узнал:

• Особенности своего организма, например, насколько быстро он перерабатывает (уровень метаболизма) кофеин. У меня оказался высокий, поэтому я не чувствую бодрости от кофе.
• предрасположенности к различным болезням. Тут целый букет о котором даже не приятно писать. Вот небольшой список: болезнь Альцгеймера, ожирение, диабет, различные онкологические заболевания... Список очень большой. Собственно, оказалось, я предрасположен к сердечно-сосудистым заболеваниям, что понятно - в семье много сердечников.
• Восприимчивость к различным лекарствам. Очень важная информация. Например, мой организм медленнее перерабатывает Плавикс, Фенобарбитал и некоторые другие лекарства. Из-за чего будут наблюдаться сильные побочные эффекты, которые могут принести больше вреда чем пользы.

В данный момент, с ноября 2013 23andme не предоставляет информацию по здоровью, и ее приходится смотреть на сторонних сайтах, руководствуясь своими данными. Это связано с письмом госорганов США в 23andme, где чиновники требуют убрать данные по здоровью. Руководствуются они при этом тем, что, получив информацию о своих предрасположенностях, неосведомленный человек сразу побежит принимать меры, и в худшем случае, что-нибудь себе отрежет у хирурга, из-за, например, большой вероятности возникновения рака в этом органе. Однако буквально на днях 19 февраля 2015, ситуация немного изменилась. Пока что данные по здоровью не предоставляют но "лед тронулся". Как обещает сооснователь 23andme бывшая супруга Сергея Брина Анне Войжитски, вопрос с данными по здоровью решится в 2015. Ждем...

По генеалогической информации мне нашли больше 900 родственников по всему миру из числа тех, кто прошел тест. С некоторыми сходятся семейные фамилии и, в ходе общения, удалось найти общего предка. В плане предков, на 99.7% я европеец, что для меня очевидно, на 0.2% азиат (монгол) и 0.1% африканец (во всех есть немного африканцев). В моих европейских генах нашли 1.7% от Ашкеназов - "европейских евреев", пытаюсь разобраться по чьей они линии. Ну и в моем ДНК 2.7% Неандертальцев, что является средним для европейцев.

Итак стоит ли проходить тест? Считаю, что однозначно ДА. Сейчас в области ДНК идут активные исследования, и если пока что-то не понятно, скоро все прояснится, и мы, скорее всего, сможем узнать много нового о нашем организме, имея результаты от 23andme. Уже сейчас некоторые сайты по данным 23andme за доп плату предоставят вам индивидуальную программу тренировок и диету, которые помогут добиться целей. Конечно, пока что все эти заявления сомнительны, т.к. серьезных исследований в этой области еще мало, но мир не стоит на месте.

Кроме того, пройдя тест вы внесете вклад в исследования 23andme, которые продвигают наши границы знаний о ДНК.

Ну и конечно генеалогическая информация - тут без комментариев. Приятно возобновить связи с потерянными ветками. В случае если вы были усыновлены или потеряли ветку своей семьи, то, возможно, 23andme поможет вам найти утерянные части. На сайте 23andme куча историй о воссоединении потерявшихся родственников со слезами, соплями и улыбками - этакий "Жди меня".

И еще, в некоторые страны, включая Россию и Украину 23andme не отправляет тестовые наборы из-за законодательства. Законно из стран бывшего СССР отправить генетический материал (в данном случае слюну) очень сложно - можно утонуть в бюрократии, в поисках разрешения, и ничего не добиться. Про процесс заказа и отправки своей ДНК я напишу чуть позже, но пока что все прокатывает на дурака. Возможно, как это у нас бывает, лавочку скоро прикроют и за отправку своего ДНК к ужасным америкосам в худшем случае будут расстреливать.  Пока возможность есть, надо однозначно делать тест.

Я же тут продолжу информировать вас о том, что можно узнать о себе с помощью ДНК.